Töreboda kommun har inte en traditionell nämndsorganisation. Istället har en stor del av verksamheten samlats under kommunstyrelsen som i sin tur har ett antal utskott. Utöver kommunstyrelsen finns en valnämnd. Töreboda kommun delar gemensamma nämnder med andra samarbetskommuner.
Töreboda kommun har genom en omfattande samverkan med Gullspång och Mariestads kommuner även valda ledamöter i kommunernas gemensamma nämnder.